برخی از بازرگانان افغانستان، می‌گویند که موافقت نامه ترانزیتی افغانستان و پاکستان، یک جانبه و به نفع پاکستان است. در این موافقتنامه تنها و یک جانبه به پاکستانی ها برای انتقال اجناس آسیای میانه از خاک افغانستان، به پاکستان اجازه داده شده است و افغانستان فقط مجاز است تا اجناس خود را به بندر واگه منتقل کند و حق ندارد اجناس هندی را از خاک پاکستان وارد افغانستان نماید.